启动子是合成生物学、代谢工程中控制和调控基因表达的重要工具,其作用强度会影响基因表达产物的产量和细胞代谢水平。为寻找合适的启动子,研究人员获得了POL1~POL5、CBF
1共6种启动子,将其分别与荧光蛋白基因EGFP构建成重组型启动子并导入毕赤酵母细胞,以研究启动子的作用强度。含CBF1-EGFP重组型启动子质粒的结构如图所示,用于扩增CBF1和EGFP的引物的碱基序列如表1所示。回答下列问题:
表1
引物名称 | 序列(5'→3') |
CBF1引物1 | CCGGAATTCCGTTAGGACTTCTT |
CBF1引物2 | TCCTCGCCCTTGCTCACCATT |
EGFP引物1 | ATGGTGAGCAAGGGCGAGGA |
EGFP引物2 | ACGCGTCGACTTACTTGTACAG |
注:引物序列之外、CBF1和EGFP无表中相关限制酶识别和切割序列。
(1)在PCR扩增启动子CBF1时,CBF1引物1与模板链结合后,在
___酶的作用下将脱氧核苷酸连接到引物的
___(填“3'”或“5'”)端,以延伸子链。
(2)限制酶及识别序列如表2所示。构建CBF1-EGFP重组型启动子质粒时,要选择
___限制酶分别对图中a、b两处进行切割,EGFP的下游需要添加
___序列,使转录终止。
表2
限制酶 | BamHI | EcoRI | SalI | SmaI |
识别和切割序列 | G↓GATCC | G↓AATTC | G↓TCGAC | GGG↓CCC |
(3)检测含CBF1-EGFP重组型启动子质粒是否构建成功时,将重组质粒导入酵母菌。培养后将酵母菌涂布到含有
___的培养基上,挑选单菌落并提取DNA,经酶切后利用表1中所示的
___两种引物进行PCR扩增和鉴定。
(4)EGFP基因能表达荧光蛋白,蛋白质含量与荧光强度呈正相关。为比较POL1~POL5、CBF1这6种启动子的作用强度,应分别检测
___。若POL3的作用强度最强,则预期结果是
___。